More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0063 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  92.15 
 
 
395 aa  764    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  100 
 
 
396 aa  817    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1242  aspartate aminotransferase  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  59.34 
 
 
401 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  51.15 
 
 
409 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  49.49 
 
 
397 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  47.59 
 
 
398 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 
399 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  47.07 
 
 
396 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  48.6 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  48.6 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  48.09 
 
 
398 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1507  aspartate aminotransferase  45.57 
 
 
400 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1646  aspartate aminotransferase  45.43 
 
 
408 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  43.72 
 
 
401 aa  361  1e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  34.56 
 
 
390 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 
384 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  34.63 
 
 
384 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 
402 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  28.26 
 
 
399 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  32 
 
 
397 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 
397 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  28.82 
 
 
397 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 
402 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  33.84 
 
 
387 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.85 
 
 
395 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.62 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  31.84 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  31.34 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.04 
 
 
385 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  31.21 
 
 
416 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.31 
 
 
370 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  28.32 
 
 
399 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  30.9 
 
 
399 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  32.69 
 
 
385 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  31.47 
 
 
417 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  32.42 
 
 
387 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  32.69 
 
 
387 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  32.42 
 
 
387 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  32.42 
 
 
387 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 
388 aa  169  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  32.42 
 
 
388 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  33.73 
 
 
375 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  30.33 
 
 
396 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 
398 aa  168  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.6 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  31.87 
 
 
387 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  31.87 
 
 
387 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.35 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  30.03 
 
 
392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  29.18 
 
 
396 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  29.27 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  31.59 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  31.08 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  32.78 
 
 
394 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.99 
 
 
407 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.33 
 
 
404 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  29.87 
 
 
400 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  31.59 
 
 
387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  31.59 
 
 
387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  28.83 
 
 
391 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  30.34 
 
 
399 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 
385 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  31.54 
 
 
379 aa  162  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  32.02 
 
 
373 aa  162  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  28.75 
 
 
395 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
385 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  30.4 
 
 
375 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  30.18 
 
 
397 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  30.2 
 
 
392 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.22 
 
 
390 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.46 
 
 
395 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 
411 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  28.5 
 
 
395 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 
380 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  30.2 
 
 
392 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.37 
 
 
387 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  29.93 
 
 
392 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  30.29 
 
 
393 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  32.53 
 
 
389 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 
386 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  27.96 
 
 
403 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  28.43 
 
 
397 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  30.47 
 
 
408 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  32.08 
 
 
393 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.15 
 
 
395 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  31.15 
 
 
387 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  31.48 
 
 
379 aa  159  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  31.29 
 
 
388 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  30 
 
 
391 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>