96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0061 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0061  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 478 aa  974    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  54.15 
 
 		 991 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1809  glycosyl transferase group 1  53.22 
 
 		 780 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0170  glycosyl transferase group 1  51.99 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  45.7 
 
 		 885 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0513  glycosyl transferase, group 1  42.79 
 
 		 924 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.56 
 
 		 711 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 540 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4979  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5364  hypothetical protein  25.45 
 
 		 714 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5122  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.1 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5514  group 1 family glycosyl transferase  25.1 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3848  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 751 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27940  glycosyltransferase  21.07 
 
 		 739 aa  80.1  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4969  glycosyltransferase  26.91 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2527  glycosyltransferase  24.52 
 
 		 726 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26690  glycosyltransferase  23.28 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08950  glycosyltransferase  21.57 
 
 		 731 aa  64.3  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.691292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  28.48 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 311 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 365 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 		 632 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 		 810 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 		 355 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 227 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 287 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1149  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.66 
 
 		 265 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588418  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1057  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.66 
 
 		 265 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0988004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 878 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 		 2240 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.38 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 955 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3394  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 589 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.06 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 3145 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.3 
 
 		 957 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  43.14 
 
 		 573 aa  47.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 356 aa  47  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  43.4 
 
 		 1331 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  24.09 
 
 		 391 aa  47  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1298  hypothetical protein  40.74 
 
 		 383 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.89 
 
 		 364 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 927 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.68 
 
 		 591 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 4079 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 935 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  30.85 
 
 		 1324 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  29.81 
 
 		 288 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 245 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 762 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 870 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54068  n-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  27.5 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2813  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 324 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  31.25 
 
 		 380 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 350 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1213  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  22.29 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  28.87 
 
 		 792 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 620 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 343 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  29.59 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  25.9 
 
 		 350 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  31.47 
 
 		 2822 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 350 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.07 
 
 		 280 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26.32 
 
 		 299 aa  43.5  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.97 
 
 		 807 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 968 aa  43.5  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 396 aa  43.5  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 649 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  25.9 
 
 		 350 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 649 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.73 
 
 		 880 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>