20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0022 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 730 aa  1486    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 		 1131 aa  113  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  39.81 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1902 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  40.4 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  36.19 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.18 
 
 		 680 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  27.67 
 
 		 480 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2352  fibronectin, type III domain-containing protein  37.14 
 
 		 494 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  25.2 
 
 		 393 aa  52  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  36.11 
 
 		 2178 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0633  fibronectin, type III domain-containing protein  30.63 
 
 		 317 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  24.56 
 
 		 2286 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  28.17 
 
 		 1887 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  29.29 
 
 		 2079 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1611  LVIVD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 568 aa  48.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  24.36 
 
 		 1779 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.2 
 
 		 6885 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  29.61 
 
 		 580 aa  44.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  29.86 
 
 		 2170 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>