96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0016 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0016  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 		 328 aa  665    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0762118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  51.42 
 
 		 641 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.3 
 
 		 658 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.24 
 
 		 696 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  26.35 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.67 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.61 
 
 		 758 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 		 701 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.9 
 
 		 672 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.13 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.53 
 
 		 613 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.1 
 
 		 907 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.91 
 
 		 611 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  23.02 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  24.02 
 
 		 794 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.22 
 
 		 737 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  23.58 
 
 		 741 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  22.22 
 
 		 746 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  35.42 
 
 		 751 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.23 
 
 		 744 aa  59.3  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  25.69 
 
 		 738 aa  59.3  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  24.22 
 
 		 758 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  24 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  23.05 
 
 		 766 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.56 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.32 
 
 		 656 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 		 607 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  24.41 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.95 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  24.22 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.47 
 
 		 936 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  25.91 
 
 		 632 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 854 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25 
 
 		 825 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  23.93 
 
 		 671 aa  56.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 794 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.81 
 
 		 869 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  21.84 
 
 		 799 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.73 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  21.69 
 
 		 729 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  29.17 
 
 		 913 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2109  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.52 
 
 		 777 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.88 
 
 		 597 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 795 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 795 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  20.32 
 
 		 744 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1394  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.81 
 
 		 924 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.640211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 819 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.63 
 
 		 758 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  30 
 
 		 543 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  19.44 
 
 		 499 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.9 
 
 		 575 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.11 
 
 		 694 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  23.03 
 
 		 671 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1407  metal dependent phosphohydrolase  22.4 
 
 		 691 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  22.54 
 
 		 759 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  23.83 
 
 		 760 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  21.89 
 
 		 641 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.42 
 
 		 764 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.53 
 
 		 657 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 		 756 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.81 
 
 		 777 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.9 
 
 		 753 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 828 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.07 
 
 		 777 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 829 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 645 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  46.15 
 
 		 725 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5631  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  33.33 
 
 		 904 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.03 
 
 		 757 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  22.93 
 
 		 686 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  21.2 
 
 		 721 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  23.78 
 
 		 729 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  25.53 
 
 		 717 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 759 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  29.59 
 
 		 582 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 754 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  46.15 
 
 		 723 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  44.64 
 
 		 731 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 785 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.67 
 
 		 701 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.61 
 
 		 628 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>