More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0010 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0010  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 
91 aa  175  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  6.49518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0429  histone family protein DNA-binding protein  71.74 
 
 
92 aa  127  5e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00929572  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 
91 aa  107  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 
90 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.52537e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
90 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0658  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 
90 aa  104  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0682  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 
90 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.651291  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  59.09 
 
 
91 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  2.65027e-13 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  5.12711e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.25838e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  58.14 
 
 
90 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 
91 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 
90 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 
90 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 
90 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.96782e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  8.54913e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  54.95 
 
 
91 aa  97.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 
90 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  4.81156e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  3.11196e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.17185e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.08882e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  4.05619e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.41643e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.16647e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  52.75 
 
 
91 aa  93.6  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  54.55 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  2.11181e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  53.33 
 
 
90 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.46031e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 
91 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 
92 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0180  histone family protein DNA-binding protein  55.81 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  4.56063e-10  normal  0.670354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
92 aa  91.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.954e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 
91 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  4.7794e-07  unclonable  4.40637e-05 
 
 
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4008  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  7.35771e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0431  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00947903  hitchhiker  0.00103246 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  45.56 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.97119e-14  hitchhiker  9.85943e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  48.89 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
90 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 
92 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 
92 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 
91 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0673  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
92 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 
91 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.94497e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.37544e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.33039e-12  hitchhiker  6.38901e-09 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  6.76058e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  47.78 
 
 
90 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  1.65888e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  51.11 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  47.73 
 
 
88 aa  87  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 
90 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
98 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 
90 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
98 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  46.67 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>