More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0008 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  62.88 
 
 		 132 aa  187  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  62.88 
 
 		 132 aa  186  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  61.24 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  62.02 
 
 		 130 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  56 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  59.85 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  53.08 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  53.85 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  55.12 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  53.03 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  51.54 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  57.14 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  54.2 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  53.03 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  51.18 
 
 		 152 aa  156  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  50.38 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  50.76 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  55.38 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  49.61 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  51.54 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  51.97 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  48.85 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  48.85 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  51.54 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  51.61 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  52.71 
 
 		 133 aa  150  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  48.41 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  51.97 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  47.37 
 
 		 133 aa  147  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  50.38 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  47.76 
 
 		 134 aa  146  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  47.69 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  50.38 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  46.51 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  46.83 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  48.85 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  45.93 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  48.84 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  46.51 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  46.51 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  43.94 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  46.55 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  48.09 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  45.38 
 
 		 136 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  44.62 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  46.88 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  45.24 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.1 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  40.62 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  39.39 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  44.44 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  40.15 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  40.16 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  37.6 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  51.09 
 
 		 145 aa  95.9  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  35.66 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  54.95 
 
 		 140 aa  95.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  39.69 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  34.35 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  42.4 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  38.35 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  42.72 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  42.64 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  39.67 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  38.05 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  39.06 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  32.33 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  43.69 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  39.06 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  41.74 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.11 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  45.13 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  40.83 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  41.67 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  38.35 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  37.59 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  48.96 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  36.84 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  39.83 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  39.17 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  43.59 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  43.59 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.88 
 
 		 584 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>