More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5054 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  100 
 
 
284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  53.55 
 
 
281 aa  287  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  44.37 
 
 
282 aa  250  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  42.96 
 
 
288 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  40.99 
 
 
286 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  42.86 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  41.48 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  41.33 
 
 
282 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  44.4 
 
 
276 aa  192  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  45.29 
 
 
285 aa  189  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  42.8 
 
 
277 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  42.18 
 
 
271 aa  177  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  42.79 
 
 
330 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  36 
 
 
293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  37.22 
 
 
304 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.72 
 
 
285 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  38.66 
 
 
285 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.5 
 
 
285 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  40.24 
 
 
279 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.89 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.97 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  35.34 
 
 
296 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.62 
 
 
280 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  41.26 
 
 
262 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  41.84 
 
 
285 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.77 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.4 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  35.85 
 
 
301 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.29 
 
 
284 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.4 
 
 
293 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  35.02 
 
 
284 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  37.74 
 
 
288 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.77 
 
 
288 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  33.73 
 
 
288 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  41.4 
 
 
282 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  34.52 
 
 
297 aa  142  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.21 
 
 
284 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.73 
 
 
289 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  36.65 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  36.65 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  36.61 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.05 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.25 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.84 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.74 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  35.02 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  36.25 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  36.84 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  39.72 
 
 
283 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.63 
 
 
283 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  40.65 
 
 
283 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  39.36 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  38.79 
 
 
283 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  34.4 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  39.07 
 
 
359 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  32.81 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.6 
 
 
293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  29.5 
 
 
280 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  33.06 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.88 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.19 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  39.91 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  30 
 
 
285 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  36.11 
 
 
286 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.4 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  33.72 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  35.6 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  30.97 
 
 
275 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  35.4 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.96 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.46 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  35.59 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  39.15 
 
 
305 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  28.42 
 
 
307 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  36.16 
 
 
314 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  31.78 
 
 
317 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  34.19 
 
 
280 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  32.5 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  32.79 
 
 
285 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.11 
 
 
286 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  34.51 
 
 
274 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  32.41 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  33.61 
 
 
287 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.83 
 
 
280 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  35.81 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  32.67 
 
 
298 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  35.81 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.99 
 
 
287 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  35.81 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  35.81 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.33 
 
 
285 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  32.03 
 
 
297 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  33.2 
 
 
284 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  35.81 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  35.81 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  35.81 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  31.62 
 
 
299 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  33.07 
 
 
270 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  37.33 
 
 
587 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>