More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5025 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  930    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  55.73 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  54.17 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  38.33 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  35.48 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  32.59 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  32.77 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  32.76 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  30.79 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  28.73 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  29.91 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  29.04 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  31.11 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  30.02 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30.02 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30.02 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.95 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  28.38 
 
 		 465 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  28.67 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 461 aa  200  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.58 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  27.79 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  31.05 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  28.17 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  28.48 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  28.76 
 
 		 457 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  28.38 
 
 		 457 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 462 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  28.54 
 
 		 457 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  30.65 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  30.65 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  30.65 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  30.15 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  30.43 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  30.15 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  30.15 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  30.15 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  29.78 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 453 aa  186  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  29.78 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  29.78 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  28.7 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  28.51 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  28.7 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  29.46 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  29.28 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  28.1 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  29.82 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  29.82 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  29.82 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  30.04 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  29.54 
 
 		 453 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 459 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 470 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  25.34 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  27.88 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  27 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  27.88 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  27.88 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>