More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5013 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
233 aa  480  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  62.28 
 
 
233 aa  296  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  59.39 
 
 
229 aa  274  7e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  59.46 
 
 
229 aa  259  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  56.77 
 
 
235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  57.85 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  56.7 
 
 
230 aa  251  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  55.26 
 
 
226 aa  248  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  54.94 
 
 
234 aa  243  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  56.71 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  50.43 
 
 
227 aa  222  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  50.45 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  52.85 
 
 
276 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  54.45 
 
 
278 aa  198  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  55.08 
 
 
237 aa  198  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  52.33 
 
 
276 aa  197  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  53.3 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  53.3 
 
 
278 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  53.3 
 
 
278 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  50.8 
 
 
243 aa  191  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  50.27 
 
 
259 aa  188  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  52.15 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  49.74 
 
 
243 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  52.15 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  52.15 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  52.15 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  52.15 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 
276 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  51.6 
 
 
279 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  51.6 
 
 
279 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  51.6 
 
 
273 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  51.6 
 
 
279 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  51.6 
 
 
273 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  53.51 
 
 
243 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  51.6 
 
 
279 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  51.6 
 
 
279 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  51.06 
 
 
273 aa  185  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  49.48 
 
 
248 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  50.53 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  50.26 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  51.06 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  49.47 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  50.53 
 
 
258 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  48.95 
 
 
243 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  50.53 
 
 
244 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  49.47 
 
 
243 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  48.73 
 
 
235 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 
241 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  49.48 
 
 
247 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  50.53 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  49.48 
 
 
243 aa  178  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  49.48 
 
 
246 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  51.31 
 
 
242 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  48.97 
 
 
246 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 
240 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  49.46 
 
 
226 aa  174  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  49.74 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  48.7 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.48 
 
 
245 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  47.12 
 
 
239 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  48.39 
 
 
233 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  42.08 
 
 
246 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  49.46 
 
 
235 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  47.87 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  46.6 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  42.78 
 
 
237 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  46.03 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  44.6 
 
 
232 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  46.81 
 
 
239 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  46.52 
 
 
230 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  45.21 
 
 
253 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1154  conserved hypothetical protein, putative NAD-dependent deacetylase  45.6 
 
 
232 aa  156  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000113398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  43.85 
 
 
241 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 
264 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  43.48 
 
 
244 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 
241 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  45.41 
 
 
248 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  40.96 
 
 
237 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  47.31 
 
 
256 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  40.38 
 
 
237 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2216  silent information regulator protein Sir2  47.89 
 
 
235 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2492  Silent information regulator protein Sir2  47.89 
 
 
235 aa  144  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1194  NAD-dependent deacetylase  39.09 
 
 
233 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0597441  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  47.03 
 
 
230 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  39.22 
 
 
233 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  47.03 
 
 
230 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1487  Silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 
230 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.72672  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1071  NAD-dependent deacetylase  40.86 
 
 
233 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.202923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  36.61 
 
 
251 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  41.4 
 
 
249 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 
269 aa  142  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  38.17 
 
 
258 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  43.17 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  43.32 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  41.54 
 
 
237 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  41.54 
 
 
237 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  41.54 
 
 
237 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  37.2 
 
 
230 aa  138  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  40.55 
 
 
273 aa  138  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>