More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5001 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  82.88 
 
 		 228 aa  378  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  75.89 
 
 		 226 aa  357  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  68.78 
 
 		 260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  69.68 
 
 		 240 aa  334  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  67.12 
 
 		 236 aa  332  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  70.14 
 
 		 238 aa  326  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  66.37 
 
 		 244 aa  314  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  64.86 
 
 		 248 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 		 255 aa  299  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  62.95 
 
 		 233 aa  296  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  62.22 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  61.78 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  62.11 
 
 		 247 aa  291  7e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  60.09 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  60.09 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  63.06 
 
 		 229 aa  288  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  60.62 
 
 		 227 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  60 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  59.91 
 
 		 236 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  58.74 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 230 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  58.82 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  58.22 
 
 		 225 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  58.93 
 
 		 229 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  61.9 
 
 		 236 aa  277  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  59.17 
 
 		 228 aa  277  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  58.97 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  57.66 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  59.11 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  59.11 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  59.11 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  58.95 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  57.52 
 
 		 247 aa  274  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  57.21 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 246 aa  274  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  55.11 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  58.37 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  58.56 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  57.66 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  55.7 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  56.56 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  56.56 
 
 		 237 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  56.76 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  56.76 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  55.2 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  60.89 
 
 		 242 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  57.47 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  56.64 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  60.36 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  58.48 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  58.15 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  57.73 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  53.74 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  56.76 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  56.31 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  55.56 
 
 		 652 aa  264  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  55.5 
 
 		 288 aa  263  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  54.46 
 
 		 291 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  56 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  57.4 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  55.2 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  57.92 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  55.66 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  56.95 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  56.95 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  53.12 
 
 		 640 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  55.96 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  55.31 
 
 		 656 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  62.19 
 
 		 233 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  57.66 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  55.61 
 
 		 644 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  54.46 
 
 		 641 aa  259  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  55.51 
 
 		 657 aa  258  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  53.1 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  55.96 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  53.54 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  53.54 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  59.31 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  54.87 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  56.94 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  53.1 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  53.1 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  52.7 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>