182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4938 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 83 aa  157  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  68.67 
 
 		 82 aa  103  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  65.06 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  66.27 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  62.5 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  55.42 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  60.24 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  60.24 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  37.35 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  40.26 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  39.53 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  39.74 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  39.74 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  41.67 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>