More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4881 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  66.45 
 
 
471 aa  680    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  973    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  64.92 
 
 
463 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  60.34 
 
 
471 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  62.31 
 
 
466 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  57.69 
 
 
470 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  59.96 
 
 
470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  55.41 
 
 
470 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.59 
 
 
472 aa  518  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.62 
 
 
471 aa  520  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  50.55 
 
 
467 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  42.61 
 
 
459 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  42.61 
 
 
459 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 
459 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  40.13 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  36.9 
 
 
459 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  36.32 
 
 
472 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 
476 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 
444 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
617 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  34.88 
 
 
455 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 
480 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
480 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 
467 aa  254  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 
469 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 
466 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  32.78 
 
 
471 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  33.03 
 
 
442 aa  236  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  36.66 
 
 
456 aa  236  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.88 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.88 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  34.09 
 
 
478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.27 
 
 
478 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.47 
 
 
478 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
476 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 
464 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
470 aa  222  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  30.4 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  33.26 
 
 
457 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
478 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.85 
 
 
456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  33.69 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  31.53 
 
 
448 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  30.37 
 
 
450 aa  210  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 
469 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 
480 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
444 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
444 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  30.79 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 
476 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
462 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
471 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
455 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  30.11 
 
 
453 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
453 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
453 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.5 
 
 
470 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 
464 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 
472 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  29.98 
 
 
451 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.2 
 
 
453 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.43 
 
 
502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
454 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  28.6 
 
 
446 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 
488 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
452 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 
470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
470 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  37.89 
 
 
244 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.73 
 
 
243 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  37 
 
 
244 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 
246 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  36.15 
 
 
251 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 
375 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 
243 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 
243 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 
243 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.67 
 
 
354 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 
390 aa  123  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  33.47 
 
 
397 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  27.87 
 
 
346 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>