32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4877 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  100 
 
 
591 aa  1184    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  37.79 
 
 
606 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3136  hypothetical protein  27.98 
 
 
648 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0896  hypothetical protein  31.11 
 
 
672 aa  210  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.693496  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  29.59 
 
 
643 aa  176  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0608  hypothetical protein  30.28 
 
 
1404 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  33.62 
 
 
666 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  30.97 
 
 
230 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  30.97 
 
 
230 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  29.77 
 
 
654 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  27.43 
 
 
229 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  33.64 
 
 
218 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  36.23 
 
 
253 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  23.5 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  30.19 
 
 
638 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.82 
 
 
681 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  27.1 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  28.97 
 
 
593 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0407  ABC transporter related  26.67 
 
 
235 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  32.5 
 
 
482 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  35.53 
 
 
532 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  27.19 
 
 
460 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  30.77 
 
 
304 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  33.33 
 
 
264 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  26.99 
 
 
259 aa  44.3  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  34.34 
 
 
430 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1827  ABC transporter related  28.41 
 
 
260 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
286 aa  43.9  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  32.29 
 
 
264 aa  43.9  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3389  ABC transporter related  30.67 
 
 
261 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  35.71 
 
 
336 aa  43.5  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1250  ATPase  30.77 
 
 
237 aa  43.5  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>