More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4741 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 265 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  46.56 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  44.91 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  44.91 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  41.67 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  44.4 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  41.67 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  46.12 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  43.07 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  46.62 
 
 		 289 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  41.29 
 
 		 267 aa  234  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  40.68 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  41.67 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  42.15 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  44.78 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  41.76 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  41.76 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  41.76 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  41.76 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  41.76 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  41.76 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  39.77 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  40.23 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  40.15 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  40.23 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  45.9 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  39.77 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  39.62 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  47.18 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  41.38 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  41.76 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  39.39 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  44.49 
 
 		 267 aa  224  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  49.19 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  42.16 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  38.26 
 
 		 267 aa  221  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  41.79 
 
 		 278 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  40.08 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  41.54 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  39.02 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  39.85 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23000  TatD-related deoxyribonuclease protein  42.91 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  41.57 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  38.78 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  39.54 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  38.61 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  39.38 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  39.54 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  38.22 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  40.82 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  41.39 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  35.85 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  39 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  35.85 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  38.61 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  38.61 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  37.26 
 
 		 258 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  39.7 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.08 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.5 
 
 		 464 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  36.23 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.21 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  36.15 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  35.09 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  34.33 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.34 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.6 
 
 		 457 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.6 
 
 		 462 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.08 
 
 		 606 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.97 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  32.18 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  34.69 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  34.22 
 
 		 461 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  31.8 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.14 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04425  3'-> 5' exonuclease 1 endonuclease (Eurofung)  35.05 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0297669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  31.68 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  34.72 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  32.33 
 
 		 458 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  31.03 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.03 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  31.03 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  31.3 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.03 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  31.03 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  30.8 
 
 		 462 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  30.65 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.89 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  31.95 
 
 		 458 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>