More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4715 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1350 aa  2729    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
1121 aa  340  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.29 
 
 
982 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.96 
 
 
1203 aa  338  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
765 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1222 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
1287 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 
778 aa  323  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
837 aa  317  9e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
1075 aa  316  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
1226 aa  315  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 
1309 aa  314  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
932 aa  313  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.1 
 
 
968 aa  313  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
785 aa  310  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
631 aa  309  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
717 aa  308  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  43.97 
 
 
1179 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
1016 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.74 
 
 
1120 aa  303  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
1433 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1199 aa  303  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1202 aa  303  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1132 aa  302  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
898 aa  302  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
902 aa  301  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
1452 aa  301  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
738 aa  301  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
606 aa  301  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
973 aa  300  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
827 aa  300  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
969 aa  300  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
995 aa  300  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
718 aa  299  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
674 aa  299  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
1044 aa  298  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1287 aa  298  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
1127 aa  297  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
705 aa  297  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
944 aa  297  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  39.85 
 
 
606 aa  295  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
780 aa  295  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
969 aa  295  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.88 
 
 
853 aa  295  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
817 aa  295  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1350 aa  295  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
762 aa  294  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
685 aa  294  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
767 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.31 
 
 
777 aa  293  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.71 
 
 
620 aa  293  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
881 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  41.35 
 
 
641 aa  293  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1059 aa  294  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1267 aa  293  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1229 aa  293  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1007 aa  293  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
959 aa  291  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.7 
 
 
1560 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
902 aa  290  9e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1193 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
1099 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1193 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
647 aa  290  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 
785 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1029 aa  289  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1078 aa  289  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  41.4 
 
 
1135 aa  289  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
724 aa  290  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  31.8 
 
 
1023 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  35.94 
 
 
1141 aa  289  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.91 
 
 
763 aa  288  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1027 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
1122 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
969 aa  288  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
916 aa  287  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
846 aa  287  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
1070 aa  287  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.73 
 
 
887 aa  287  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  41.3 
 
 
588 aa  287  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  35.74 
 
 
1028 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
947 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
743 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 
827 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1313 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  39.85 
 
 
691 aa  284  7.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1791 aa  284  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  40.31 
 
 
578 aa  284  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1765 aa  283  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
1407 aa  283  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
1110 aa  283  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
647 aa  283  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
781 aa  283  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 
653 aa  283  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  34.99 
 
 
1026 aa  282  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
662 aa  282  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
667 aa  281  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1326 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
868 aa  282  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
791 aa  281  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>