More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4708 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  47.74 
 
 
719 aa  680    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
715 aa  1428    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  44.97 
 
 
721 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  39.85 
 
 
751 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  39.58 
 
 
716 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 
732 aa  502  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  37.85 
 
 
727 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  37.41 
 
 
716 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 
709 aa  452  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  39.31 
 
 
708 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  34.47 
 
 
688 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 
706 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 
686 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  36.24 
 
 
679 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 
692 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  36.45 
 
 
689 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  36.56 
 
 
681 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 
712 aa  287  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 
698 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  31.77 
 
 
698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
692 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
722 aa  250  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.34 
 
 
699 aa  209  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.75 
 
 
699 aa  193  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  34.52 
 
 
408 aa  178  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
395 aa  125  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  22.21 
 
 
747 aa  122  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  24.75 
 
 
723 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  23.71 
 
 
764 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  25.05 
 
 
614 aa  110  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
611 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  25.1 
 
 
609 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 
609 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.92 
 
 
609 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 
614 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 
614 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.92 
 
 
609 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  25.92 
 
 
609 aa  107  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  25.92 
 
 
609 aa  107  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.92 
 
 
609 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.92 
 
 
609 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.67 
 
 
609 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  23.5 
 
 
715 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  23.67 
 
 
715 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.92 
 
 
609 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 
389 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  24.32 
 
 
375 aa  104  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.02 
 
 
387 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.48 
 
 
387 aa  104  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.8 
 
 
609 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 
389 aa  103  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.75 
 
 
387 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.75 
 
 
387 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.27 
 
 
386 aa  103  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.75 
 
 
387 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.48 
 
 
387 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.48 
 
 
387 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.75 
 
 
387 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.48 
 
 
387 aa  102  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.48 
 
 
387 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 
404 aa  101  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 
389 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  21.72 
 
 
756 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.35 
 
 
379 aa  96.3  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  28.93 
 
 
375 aa  95.5  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.88 
 
 
375 aa  94  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  22.87 
 
 
767 aa  93.6  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.56 
 
 
375 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
387 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  20.45 
 
 
715 aa  92  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.88 
 
 
375 aa  92  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 
399 aa  92  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.88 
 
 
375 aa  92  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.88 
 
 
375 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.88 
 
 
375 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.88 
 
 
375 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 
567 aa  91.3  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.54 
 
 
399 aa  90.9  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.54 
 
 
396 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  21.58 
 
 
775 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 
530 aa  89  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.33 
 
 
670 aa  87.8  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.4 
 
 
567 aa  87.8  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  22.28 
 
 
482 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 
666 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.06 
 
 
608 aa  85.5  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.67 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  24.71 
 
 
951 aa  84.3  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 
445 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 
404 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  24.36 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  24.34 
 
 
806 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
666 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  27.88 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.88 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  23.66 
 
 
389 aa  80.5  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  27.88 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>