More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4653 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  100 
 
 
306 aa  617  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  68.32 
 
 
302 aa  424  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  63.25 
 
 
302 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  62 
 
 
305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  62 
 
 
305 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  62 
 
 
305 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  60.67 
 
 
307 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  60.07 
 
 
305 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  59.47 
 
 
306 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  58.67 
 
 
306 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  60.33 
 
 
305 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  61.33 
 
 
321 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  60.33 
 
 
305 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  58.75 
 
 
305 aa  378  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  59.41 
 
 
306 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  60.86 
 
 
305 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  59 
 
 
305 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  58.33 
 
 
305 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  51.64 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  51.64 
 
 
312 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  51.16 
 
 
304 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  52.82 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  55.18 
 
 
308 aa  301  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  53.51 
 
 
305 aa  300  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.22 
 
 
308 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  54.49 
 
 
311 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  49.84 
 
 
311 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.17 
 
 
310 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.17 
 
 
310 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  51.96 
 
 
308 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  52.33 
 
 
303 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  53.54 
 
 
300 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  49.01 
 
 
310 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  53.64 
 
 
318 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  52.79 
 
 
307 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  53.54 
 
 
300 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  54.15 
 
 
306 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  52.53 
 
 
306 aa  292  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  53.27 
 
 
311 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  52.32 
 
 
306 aa  290  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  54.7 
 
 
309 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  53.77 
 
 
307 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  53.44 
 
 
307 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  53.11 
 
 
307 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  53.11 
 
 
307 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  53.11 
 
 
307 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  53.11 
 
 
307 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  53.44 
 
 
307 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.79 
 
 
307 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  51.32 
 
 
310 aa  285  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  52.46 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  50.67 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  47.49 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  51.5 
 
 
305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  52.46 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  53.77 
 
 
309 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  51.17 
 
 
321 aa  280  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  52.33 
 
 
310 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  52.49 
 
 
311 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  48.48 
 
 
309 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  52.51 
 
 
309 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  48.48 
 
 
309 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.16 
 
 
310 aa  278  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  49.5 
 
 
301 aa  278  9e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  48.85 
 
 
307 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  50 
 
 
320 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  48.99 
 
 
309 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  49.32 
 
 
304 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  50.33 
 
 
320 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  48.99 
 
 
310 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  48.15 
 
 
309 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  52.33 
 
 
309 aa  275  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  50 
 
 
307 aa  275  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  52.13 
 
 
316 aa  275  5e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.65 
 
 
309 aa  275  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  49.49 
 
 
304 aa  275  6e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  50.98 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  50.98 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  50.33 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  47.35 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  52.32 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  49.67 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  46.75 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  52.32 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  46.53 
 
 
306 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  50 
 
 
320 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  49.67 
 
 
320 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  51.15 
 
 
308 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  47.99 
 
 
309 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  47.19 
 
 
304 aa  270  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  47.33 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  51.84 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  50.5 
 
 
307 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  47.16 
 
 
304 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  49.33 
 
 
310 aa  267  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  48.68 
 
 
321 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  50 
 
 
316 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  48.62 
 
 
291 aa  266  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  50.67 
 
 
309 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  49.31 
 
 
290 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>