252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4651 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  823    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  73.91 
 
 
418 aa  597  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  65.87 
 
 
421 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  52.73 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  51.62 
 
 
569 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  38.3 
 
 
436 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  32.71 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  38.06 
 
 
593 aa  211  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  32.64 
 
 
442 aa  207  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  41.75 
 
 
379 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  36.78 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  35.54 
 
 
582 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  37.47 
 
 
580 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  39.43 
 
 
442 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  39.94 
 
 
347 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  34.69 
 
 
580 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  36.04 
 
 
611 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  32.97 
 
 
449 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  37.26 
 
 
579 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  36.29 
 
 
375 aa  176  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  33.33 
 
 
593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  35.29 
 
 
579 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  30.26 
 
 
434 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  31.29 
 
 
390 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  27.06 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  26.91 
 
 
473 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  32.87 
 
 
445 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  28.74 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  37.88 
 
 
391 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  29.83 
 
 
450 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  28.57 
 
 
498 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  27.41 
 
 
489 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  27.69 
 
 
492 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  27.44 
 
 
480 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  25.55 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  28.12 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.75 
 
 
352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  24.57 
 
 
493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  28.04 
 
 
478 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  25.32 
 
 
357 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  27.33 
 
 
487 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  27.53 
 
 
472 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  25.94 
 
 
360 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  29.03 
 
 
348 aa  106  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  28.62 
 
 
479 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  28.03 
 
 
360 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  26.16 
 
 
348 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.04 
 
 
339 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  26.19 
 
 
355 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  24.05 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  27.56 
 
 
331 aa  100  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  25.17 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  23.66 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  26.32 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  27.18 
 
 
335 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  24.18 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  27.07 
 
 
483 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  25.18 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  26.92 
 
 
327 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  27.33 
 
 
324 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  30.3 
 
 
467 aa  93.6  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  25.18 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  24.91 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  25.18 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  29.83 
 
 
467 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  26.26 
 
 
338 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  25.9 
 
 
343 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  24.92 
 
 
341 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  23.48 
 
 
365 aa  86.3  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  23.17 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  23.61 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  25.7 
 
 
331 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  22.18 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  24.18 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  24.04 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  32.6 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  25.83 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  27.12 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  25.2 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  26.48 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  24.54 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  26.23 
 
 
327 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  26.22 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  25.66 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  26.21 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  27.37 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  23.89 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  23.65 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  23.57 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  24.91 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  23.67 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  24.14 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  22.43 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  22.95 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  21.9 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  25.48 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  25.2 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  27.12 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>