31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4599 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  805    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  45.84 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  44.02 
 
 
399 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  41.84 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  39.9 
 
 
396 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  37.8 
 
 
408 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  34.15 
 
 
433 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  33.17 
 
 
431 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  34.46 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  32.24 
 
 
401 aa  203  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  30.69 
 
 
419 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  28.57 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  30.18 
 
 
407 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  29.58 
 
 
444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  28.21 
 
 
399 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  27.11 
 
 
402 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  25.65 
 
 
417 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  22.92 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  20.16 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  22.82 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  20.94 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  21.11 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  20.22 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  21.29 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  20.66 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  19.34 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  18.72 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  20.61 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  24.46 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  21.24 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  20.7 
 
 
357 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>