More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4540 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  51.44 
 
 
666 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  52.13 
 
 
653 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
643 aa  1323    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  49.07 
 
 
665 aa  635    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  46.8 
 
 
650 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  43.2 
 
 
660 aa  517  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
642 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  38.03 
 
 
626 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  35.76 
 
 
645 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 
712 aa  361  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  34.23 
 
 
630 aa  323  5e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  31.06 
 
 
757 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  32.42 
 
 
648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  32.51 
 
 
668 aa  306  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  31.92 
 
 
677 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  28.75 
 
 
798 aa  283  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  31.97 
 
 
656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 
613 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  29.26 
 
 
620 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.93 
 
 
672 aa  220  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
813 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.6 
 
 
671 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.46 
 
 
673 aa  209  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.73 
 
 
640 aa  208  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 
631 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.43 
 
 
641 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.78 
 
 
903 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  29.98 
 
 
471 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.63 
 
 
679 aa  181  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  28.25 
 
 
734 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 
585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  27.7 
 
 
658 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
638 aa  171  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  27.29 
 
 
630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.39 
 
 
656 aa  161  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  38.43 
 
 
340 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  29.53 
 
 
778 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.81 
 
 
710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  25.78 
 
 
631 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  25.78 
 
 
525 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  26.78 
 
 
694 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.49 
 
 
670 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  24.51 
 
 
537 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  25.48 
 
 
669 aa  134  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.37 
 
 
648 aa  134  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  27.82 
 
 
509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.72 
 
 
704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.17 
 
 
712 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  24.9 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  23.93 
 
 
673 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  24.01 
 
 
517 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  27.79 
 
 
594 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  32.84 
 
 
366 aa  99.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 
568 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  31.52 
 
 
263 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  43.52 
 
 
478 aa  88.2  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  29.78 
 
 
432 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.2 
 
 
519 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
637 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  28.18 
 
 
412 aa  84  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.58 
 
 
447 aa  84  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  38.84 
 
 
1793 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1156  hypothetical protein  42.53 
 
 
232 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  30.46 
 
 
789 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 
623 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.72 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 
1755 aa  80.5  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
454 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
296 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.51 
 
 
422 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  22.49 
 
 
586 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.94 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.85 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.57 
 
 
1313 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.96 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  31.74 
 
 
180 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  30 
 
 
239 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  36.29 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  32.24 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  31.09 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.96 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  35.16 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 
537 aa  74.7  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  35.78 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  27.84 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  25.51 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
468 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
360 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.29 
 
 
427 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.04 
 
 
209 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.04 
 
 
226 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  36.94 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 
459 aa  72  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 
459 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>