118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4527 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3346  SH3 type 3 domain protein  55.56 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3483  SH3 type 3 domain protein  57.58 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  41.59 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  40.71 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  38.94 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  35.45 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  35.45 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.54 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  37.04 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  38.3 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  31.86 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  36.96 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  31.86 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  36.13 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  35.58 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  35.87 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 		 195 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  38.89 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  35.54 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  34.95 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  35.58 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  35.11 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  35.54 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  35.54 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  34.62 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  36.54 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  52.08 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  34.62 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  36.54 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  36.54 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  36.54 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  36.54 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  36.54 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 1910 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  35.87 
 
 		 185 aa  50.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  34.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  34.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  34.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  34.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  34.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 590 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  31.73 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  46.81 
 
 		 609 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  31.73 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  46.81 
 
 		 631 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  46.81 
 
 		 587 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  46.81 
 
 		 621 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  46.81 
 
 		 613 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  46.81 
 
 		 604 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  46.81 
 
 		 615 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  44.68 
 
 		 721 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  32.69 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  31.73 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 219 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  33.02 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  27.41 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  44.68 
 
 		 432 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.83 
 
 		 470 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  48.94 
 
 		 674 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  51.02 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  47.27 
 
 		 546 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 341 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  46.67 
 
 		 608 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  32.38 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4659  lysm domain-containing protein  46.67 
 
 		 582 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00627115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 709 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 334 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 425 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  46.81 
 
 		 274 aa  43.5  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 307 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  48.94 
 
 		 390 aa  43.5  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.67 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  45.83 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.83 
 
 		 376 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  43.75 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 389 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 399 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.82 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  40.43 
 
 		 538 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.22 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  35.42 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  37.74 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 309 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  41.18 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  46.94 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>