More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4514 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
445 aa  898    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  41.77 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  38.9 
 
 
423 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  33.12 
 
 
484 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
687 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  32.27 
 
 
463 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  32.94 
 
 
431 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
652 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  33.97 
 
 
653 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  34.58 
 
 
475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
774 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
963 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  28.4 
 
 
415 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
795 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  30.55 
 
 
611 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  30.71 
 
 
352 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  31.67 
 
 
450 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  34.29 
 
 
322 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 
322 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 
322 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 
534 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  26.49 
 
 
439 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  21.31 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  32.59 
 
 
324 aa  113  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.57 
 
 
1383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  26.73 
 
 
1454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  25.14 
 
 
514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 
611 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  26.67 
 
 
901 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  27.02 
 
 
371 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.55 
 
 
1682 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  26.74 
 
 
371 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.52 
 
 
374 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.71 
 
 
395 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 
395 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 
455 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  27.33 
 
 
469 aa  99.8  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.4 
 
 
2122 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  23.93 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  24.49 
 
 
457 aa  96.3  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 
396 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  25.63 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.14 
 
 
616 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.83 
 
 
1812 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.52 
 
 
382 aa  93.2  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 
445 aa  90.1  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.92 
 
 
386 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  22.74 
 
 
363 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  22.32 
 
 
619 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.23 
 
 
384 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 
383 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.12 
 
 
386 aa  86.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.93 
 
 
384 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.41 
 
 
412 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  22.05 
 
 
363 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  23.78 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25.84 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  22.67 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  22.88 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.22 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  28.02 
 
 
546 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.81 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  22.71 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.99 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  21.68 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.92 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 
486 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  23.17 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.17 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  21.9 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  23.17 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  23.17 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  23.17 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  23.17 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  23.17 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  23.34 
 
 
861 aa  80.5  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.56 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.21 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  20.75 
 
 
643 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  22.56 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  22.56 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  21.13 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.73 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.64 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.74 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.08 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  20.99 
 
 
475 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.43 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.79 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  26.33 
 
 
797 aa  75.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.43 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.43 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3570  Pyrrolo-quinoline quinone  21.96 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  21.95 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  21.49 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.43 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.95 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  21.95 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.04 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>