More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4467 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  69.64 
 
 		 315 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  64.92 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  61.64 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  44.7 
 
 		 335 aa  292  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  43.69 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  44.97 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  36.16 
 
 		 351 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.24 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  38.16 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  38.04 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  34.55 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  36.27 
 
 		 339 aa  191  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.61 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  37.25 
 
 		 346 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  36.59 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 386 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.46 
 
 		 336 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  27.63 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  34.42 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.15 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.32 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  35.81 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  34.43 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.3 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  33.11 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.36 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  30.48 
 
 		 348 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  30.9 
 
 		 331 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  27.91 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  27.91 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  27.18 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.05 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  31.23 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  26.91 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.34 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.7 
 
 		 342 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.48 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  29.73 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.13 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.13 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  32.58 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  26.32 
 
 		 362 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  33.6 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  28.28 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  29.12 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  29.43 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  27.36 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  25.99 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  32.37 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  30.74 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.62 
 
 		 355 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  32.01 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.86 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  27.71 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  31.01 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  29.64 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.18 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  34.73 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  26.1 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  31.71 
 
 		 389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.92 
 
 		 357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  30.53 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  30.61 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  25.9 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  25.94 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  27.46 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.67 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.96 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  30.11 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  27.48 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.21 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.05 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.05 
 
 		 351 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  29.45 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  26.23 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 		 335 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.62 
 
 		 350 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>