121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4208 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  250  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  40.91 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  42.62 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.07 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.82 
 
 		 368 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  30.4 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  29.37 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2913  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  24.14 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  30.63 
 
 		 383 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  34.92 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 240 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1148  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0914  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0680459  hitchhiker  0.00000175026 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  30.3 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2004  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  27.34 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  32.88 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 191 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  36.92 
 
 		 119 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 142 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 69 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 141 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 71 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 191 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 279 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1997  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  hitchhiker  0.000964376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 505 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  30 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  30 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4798  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0181267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  32.79 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>