More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4142 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  69.55 
 
 		 244 aa  348  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  55.37 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  54.77 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  51.46 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  48.43 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  44.54 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  48.88 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  44.89 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  47.09 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  46.67 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  45.57 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 270 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  44.16 
 
 		 261 aa  188  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  40.79 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.7 
 
 		 234 aa  178  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.79 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  47.16 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.09 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.28 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.05 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  39.64 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  42.57 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.85 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4225  alanine racemase domain protein  40.78 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0670129  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  41.96 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.26 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  38.49 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  41.38 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  40.53 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.82 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  39.21 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  38.6 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.84 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  39.21 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  40.44 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.56 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10850  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.29 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.384201  normal  0.913003 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  41.52 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.65 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  39.57 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  39.83 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  39.66 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08000  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.34 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0412796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  41.48 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  41.2 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  36.64 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  40.61 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  37.89 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  38.26 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.71 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  37.22 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.03 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40.77 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  38.39 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  37.96 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1222  hypothetical protein  37.6 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  41 
 
 		 216 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  37.28 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 		 237 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  38.01 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  38.22 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.01 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.56 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  37.99 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  36.2 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  41.87 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  37 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  38.16 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>