81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4097 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  54.84 
 
 
680 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  57.49 
 
 
673 aa  832    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  57.86 
 
 
684 aa  831    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  100 
 
 
672 aa  1395    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  39.67 
 
 
665 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  38.25 
 
 
638 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  36.28 
 
 
640 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  34.59 
 
 
655 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  35.57 
 
 
617 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  33.66 
 
 
648 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  35.11 
 
 
620 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  34.88 
 
 
634 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  33.28 
 
 
652 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  33.33 
 
 
628 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  34.18 
 
 
620 aa  356  7.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  33.19 
 
 
800 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  32.99 
 
 
646 aa  348  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  33.98 
 
 
666 aa  346  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  32.25 
 
 
636 aa  344  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  31.31 
 
 
656 aa  343  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  31.16 
 
 
656 aa  342  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
659 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  30.26 
 
 
667 aa  337  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  31.51 
 
 
634 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  31.99 
 
 
640 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  30.85 
 
 
651 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  30.7 
 
 
651 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  30.7 
 
 
651 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  31.89 
 
 
648 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  30.55 
 
 
651 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  30.55 
 
 
651 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  31.82 
 
 
652 aa  320  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  31.05 
 
 
647 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  30.69 
 
 
640 aa  313  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  30.04 
 
 
656 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  29.06 
 
 
659 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  31.57 
 
 
648 aa  300  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  36.45 
 
 
679 aa  295  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  29.72 
 
 
647 aa  293  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  29.04 
 
 
640 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  28.91 
 
 
643 aa  289  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  27.82 
 
 
742 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  28.68 
 
 
643 aa  261  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  27.86 
 
 
629 aa  260  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  27.48 
 
 
643 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  26.11 
 
 
654 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  28.74 
 
 
633 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  29.21 
 
 
686 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  26.93 
 
 
629 aa  210  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  30.36 
 
 
397 aa  179  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  24.2 
 
 
760 aa  104  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  22.9 
 
 
783 aa  97.1  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  22.54 
 
 
711 aa  96.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.45 
 
 
602 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.79 
 
 
607 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  29.92 
 
 
684 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.32 
 
 
641 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  26.64 
 
 
667 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.41 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  28.12 
 
 
678 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.45 
 
 
795 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  30.63 
 
 
838 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  21.96 
 
 
765 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  22.28 
 
 
795 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  22.41 
 
 
795 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  24.23 
 
 
844 aa  81.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  23.88 
 
 
955 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  22.42 
 
 
596 aa  78.2  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  24.59 
 
 
675 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  22.36 
 
 
1025 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  22.54 
 
 
677 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  24.87 
 
 
771 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  23.65 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  22.68 
 
 
792 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  25.89 
 
 
614 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  20.83 
 
 
963 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  23.88 
 
 
749 aa  61.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.73 
 
 
663 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  20.83 
 
 
669 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  23.83 
 
 
632 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  22.61 
 
 
881 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>