43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4093 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  67.8 
 
 		 565 aa  765    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  62.08 
 
 		 568 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1175    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  60.41 
 
 		 541 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  70.19 
 
 		 551 aa  798    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  62.26 
 
 		 701 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  36.16 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  35.51 
 
 		 770 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1023 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  37.05 
 
 		 772 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  36.95 
 
 		 819 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  32.67 
 
 		 682 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  33.56 
 
 		 843 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  34.55 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  33.6 
 
 		 924 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.4 
 
 		 999 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  31.05 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  32.92 
 
 		 593 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  31.06 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  28.8 
 
 		 450 aa  156  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  37.85 
 
 		 459 aa  150  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  30.4 
 
 		 537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  39.33 
 
 		 431 aa  140  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  38.91 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  38.66 
 
 		 421 aa  137  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  37.82 
 
 		 421 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  28.32 
 
 		 1031 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  30.03 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  34.58 
 
 		 446 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  27.43 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.24 
 
 		 1063 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  29.05 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  27.93 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1011 aa  94.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  28.63 
 
 		 670 aa  91.3  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  32.19 
 
 		 710 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  29.21 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  50 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  51.25 
 
 		 314 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  45 
 
 		 1480 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  53.66 
 
 		 14609 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  50 
 
 		 1394 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  50 
 
 		 2117 aa  44.3  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>