More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3973 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
642 aa  1322    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 
645 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  39.05 
 
 
665 aa  472  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  40.92 
 
 
650 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
643 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  40.15 
 
 
660 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  39.15 
 
 
653 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  36.58 
 
 
666 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  38.24 
 
 
630 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  37.79 
 
 
626 aa  385  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  38.12 
 
 
712 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  35.74 
 
 
757 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  30.47 
 
 
677 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 
648 aa  247  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 
668 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.79 
 
 
613 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.46 
 
 
656 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  31.26 
 
 
671 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  31.56 
 
 
798 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.41 
 
 
672 aa  201  5e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  37.77 
 
 
813 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 
631 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.84 
 
 
585 aa  184  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.59 
 
 
679 aa  170  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  30.25 
 
 
640 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.64 
 
 
734 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  25.54 
 
 
903 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  28.45 
 
 
656 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.19 
 
 
673 aa  161  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  28 
 
 
471 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 
630 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.5 
 
 
641 aa  156  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  26.77 
 
 
658 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.39 
 
 
638 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 
340 aa  140  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 
778 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.48 
 
 
620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.51 
 
 
631 aa  133  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  25.53 
 
 
710 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  22.19 
 
 
586 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.6 
 
 
704 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  24.95 
 
 
537 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  28.76 
 
 
694 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  25.05 
 
 
673 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  25.14 
 
 
517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.79 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  25.69 
 
 
525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  24.39 
 
 
712 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  26.61 
 
 
669 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  25.56 
 
 
670 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  30.21 
 
 
519 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  22.56 
 
 
648 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  24.52 
 
 
594 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  41.82 
 
 
366 aa  87.4  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  25.97 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 
227 aa  84  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 
1755 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  33.59 
 
 
224 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.4 
 
 
153 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.84 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41.41 
 
 
466 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  30.94 
 
 
568 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.86 
 
 
230 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.17 
 
 
188 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  28.64 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 
637 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
412 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.61 
 
 
218 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  36.84 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.46 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  44.21 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.71 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.99 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  35.38 
 
 
424 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  43.18 
 
 
168 aa  76.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  43.18 
 
 
168 aa  76.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.94 
 
 
200 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.05 
 
 
168 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.84 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  39.29 
 
 
193 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  28.65 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.04 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  37.1 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.94 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.52 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.52 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.05 
 
 
365 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  26.91 
 
 
427 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.04 
 
 
427 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 
263 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.39 
 
 
226 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.38 
 
 
344 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.71 
 
 
457 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.38 
 
 
294 aa  73.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>