More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3883 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  42.84 
 
 		 904 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  43.01 
 
 		 893 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  42.46 
 
 		 881 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  43.74 
 
 		 864 aa  685    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 875 aa  1819    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  39.93 
 
 		 889 aa  624  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  40.17 
 
 		 882 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  39.83 
 
 		 882 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  40.69 
 
 		 902 aa  608  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  39.72 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  38.53 
 
 		 849 aa  551  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  32.97 
 
 		 886 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.57 
 
 		 712 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  49.04 
 
 		 717 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  47.58 
 
 		 733 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  47.47 
 
 		 905 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.89 
 
 		 988 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  30.79 
 
 		 966 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  31.42 
 
 		 972 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.35 
 
 		 927 aa  354  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.02 
 
 		 923 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 831 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  30.32 
 
 		 934 aa  334  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 		 914 aa  333  9e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  30.67 
 
 		 875 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  30.37 
 
 		 928 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  30.08 
 
 		 915 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  32.17 
 
 		 772 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  28.09 
 
 		 999 aa  310  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  29.3 
 
 		 887 aa  308  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  31.88 
 
 		 906 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  29.12 
 
 		 857 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 913 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  30.15 
 
 		 870 aa  301  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.57 
 
 		 814 aa  296  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.62 
 
 		 866 aa  293  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  30.99 
 
 		 897 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  30.34 
 
 		 884 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  28.64 
 
 		 823 aa  283  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  29.33 
 
 		 913 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  27.07 
 
 		 874 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  28.16 
 
 		 832 aa  273  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  28.81 
 
 		 913 aa  267  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.07 
 
 		 820 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  27.92 
 
 		 839 aa  252  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  27.86 
 
 		 843 aa  248  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  26.07 
 
 		 845 aa  244  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 		 1212 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  35.68 
 
 		 763 aa  241  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.49 
 
 		 1357 aa  237  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  26.69 
 
 		 949 aa  236  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  27.73 
 
 		 851 aa  235  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  26.67 
 
 		 833 aa  232  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.69 
 
 		 1343 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.56 
 
 		 762 aa  229  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  26.46 
 
 		 843 aa  228  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  34.65 
 
 		 803 aa  227  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  25.52 
 
 		 836 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  31.9 
 
 		 1548 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  34.04 
 
 		 747 aa  224  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 		 756 aa  221  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  26.03 
 
 		 838 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  27.42 
 
 		 850 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35668  beta-xylosidase  33.41 
 
 		 682 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.66 
 
 		 774 aa  212  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.27 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  26.38 
 
 		 852 aa  212  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.37 
 
 		 807 aa  210  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.1 
 
 		 790 aa  210  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  34.28 
 
 		 805 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.94 
 
 		 778 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 		 777 aa  209  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.01 
 
 		 799 aa  208  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.94 
 
 		 778 aa  208  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 755 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  31.59 
 
 		 765 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  31.59 
 
 		 765 aa  207  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  25.12 
 
 		 974 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.07 
 
 		 772 aa  207  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 755 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 755 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.59 
 
 		 765 aa  207  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 755 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.59 
 
 		 765 aa  207  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.35 
 
 		 765 aa  207  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.59 
 
 		 765 aa  207  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.59 
 
 		 765 aa  207  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  27.49 
 
 		 768 aa  207  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  25.27 
 
 		 897 aa  207  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.8 
 
 		 972 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.59 
 
 		 765 aa  206  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.59 
 
 		 765 aa  206  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  31.53 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.91 
 
 		 784 aa  206  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.59 
 
 		 765 aa  206  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  32.7 
 
 		 787 aa  204  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  32.32 
 
 		 763 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  32.86 
 
 		 859 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.85 
 
 		 760 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.92 
 
 		 754 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>