134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3866 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 463 aa  954    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  37.36 
 
 		 364 aa  209  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  34.59 
 
 		 619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  34.16 
 
 		 837 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.04 
 
 		 1478 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  36.69 
 
 		 387 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  32.78 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.69 
 
 		 1041 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  33.87 
 
 		 333 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  33.87 
 
 		 347 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  33.64 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  33.96 
 
 		 454 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  32.91 
 
 		 347 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  31.95 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  32.7 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  31.94 
 
 		 689 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  34.34 
 
 		 1059 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  34.34 
 
 		 1059 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  33.74 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 		 324 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 		 369 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  32.71 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  31.99 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  34.16 
 
 		 495 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 323 aa  160  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.67 
 
 		 820 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  33.44 
 
 		 829 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  30.15 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  31.23 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  32.99 
 
 		 423 aa  156  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  32.64 
 
 		 1050 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  35.47 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  30.77 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  29.36 
 
 		 331 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  35.29 
 
 		 756 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 		 1020 aa  153  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  33.64 
 
 		 457 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.65 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.63 
 
 		 697 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.29 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  31.48 
 
 		 1037 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  30.47 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 678 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  30.58 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  29.63 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  30.47 
 
 		 1019 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 815 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  31.19 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  31.55 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  30.19 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  34.16 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  29.94 
 
 		 1018 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  31.78 
 
 		 1001 aa  146  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  31.99 
 
 		 543 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  30.38 
 
 		 806 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  29.53 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  24.84 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  31.63 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  29.43 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  32.21 
 
 		 375 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  29.67 
 
 		 778 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  29.04 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.78 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  28.48 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  31.37 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  29.97 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.7 
 
 		 1495 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  31.79 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  28.34 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  28.23 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  29.45 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 		 628 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  28.34 
 
 		 376 aa  126  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  28.53 
 
 		 756 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  28.25 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  28.41 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  27.74 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  28.05 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 619 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.25 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  27.3 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  29.49 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  27.54 
 
 		 357 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.69 
 
 		 1146 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  25.88 
 
 		 690 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  25.97 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  27.29 
 
 		 1780 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  26.1 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  25.45 
 
 		 566 aa  106  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  24.6 
 
 		 770 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  28.41 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  26.86 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  26.9 
 
 		 1331 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 1077 aa  99.8  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  23.91 
 
 		 321 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  26.78 
 
 		 2457 aa  93.2  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  25.93 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  24.31 
 
 		 627 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>