More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3758 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 316 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  66.12 
 
 		 315 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  64.92 
 
 		 309 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  62.83 
 
 		 317 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  43.04 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  41.75 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  43.81 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 351 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  38.11 
 
 		 342 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  39.31 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  39.78 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.33 
 
 		 363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  36.6 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  38.44 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 386 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.63 
 
 		 348 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  29.15 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.73 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.1 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.99 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  32.24 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  34.3 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  34.3 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.26 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  34.34 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  33.89 
 
 		 350 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  31.7 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.62 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  29.02 
 
 		 350 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  30.79 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  30.41 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  29.89 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  30.16 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  27.42 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.47 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.63 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  32.37 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.63 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.69 
 
 		 336 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  32.48 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.33 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.8 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  28.31 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  26.04 
 
 		 417 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.97 
 
 		 355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  30.15 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  29.82 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.45 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  30.45 
 
 		 350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.9 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0909  ApbE family lipoprotein  36.44 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.503634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  25.25 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.41 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.57 
 
 		 342 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.74 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  26.1 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  29.35 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.44 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  25.97 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.43 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  27.3 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  25.48 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  27.3 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  26.57 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  26.28 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  32.56 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  28.68 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.47 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  28.22 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  30.96 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  28.77 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  28.72 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  28.72 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  32.12 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  28.52 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  30.8 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>