255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3738 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  100 
 
 
432 aa  881    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  36.94 
 
 
381 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  35.83 
 
 
397 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  35.7 
 
 
381 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  30.93 
 
 
351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.06 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  25.65 
 
 
480 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  25.97 
 
 
456 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.47 
 
 
459 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  25.64 
 
 
426 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.88 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.3 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.22 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  29.26 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  26.68 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  29.18 
 
 
402 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  24.94 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  27.16 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  24.94 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  24.94 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  24.44 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  25.54 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.49 
 
 
401 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.23 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  22.41 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  23.88 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  25.68 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.68 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  24.94 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  26.11 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  26.68 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.24 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.23 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  25.5 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  25.5 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.68 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  22.57 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  26.77 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  29.13 
 
 
702 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  30.65 
 
 
1005 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  24.58 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  24.5 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  25.2 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  23.41 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  25.28 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  26.9 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  26.01 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  26.37 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  26.74 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  24.7 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.67 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  27.06 
 
 
436 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  25.43 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  25.76 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  25.85 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  24.71 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  25.09 
 
 
568 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  25.68 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  26.49 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  24.04 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  23.87 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  24.25 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  26.03 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  24.88 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0963  amidohydrolase  22.83 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  25.31 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  22.91 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  22.61 
 
 
585 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.26 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  24.24 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  26.17 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.94 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  25.1 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.4 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  23.17 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  26.17 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  26.17 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  24.15 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  23.56 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  23.76 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  22.71 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  23.36 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.81 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.17 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  23.28 
 
 
450 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  23.88 
 
 
490 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  23.23 
 
 
438 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  26.92 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  23.77 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  25.23 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  25.39 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  24.94 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  23.91 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  22.51 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  22.49 
 
 
445 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  23.44 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  24.28 
 
 
478 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  24.32 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  25 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>