More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3568 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  92.86 
 
 		 394 aa  769    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 393 aa  819    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  52.94 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  52.57 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  55.03 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  50.66 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2651  DNA-directed DNA polymerase  94.53 
 
 		 136 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.48 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.15 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 425 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.2 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  36 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 		 386 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.2 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  34.46 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.8 
 
 		 481 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  32.9 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  35.43 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  35.88 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.75 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  34.42 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  35.54 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  33.94 
 
 		 426 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.75 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.77 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  32.27 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  35.36 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.33 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3175  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 392 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  35.94 
 
 		 389 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  34.22 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  33.59 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  33.07 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  32.89 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  33.72 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  33.95 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  31.88 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 354 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  32.47 
 
 		 429 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 		 419 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  30.71 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  32.49 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  31.57 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  35.43 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  32.01 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  31.69 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3247  DNA-directed DNA polymerase  30.86 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  35.5 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  36.15 
 
 		 363 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  35.69 
 
 		 360 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  34.17 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 		 419 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  33.16 
 
 		 417 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  33.16 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  32.72 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  33.42 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  30.79 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  32.6 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  32.72 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  35.33 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  32.13 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  33.52 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  35.33 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  31.48 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  31.48 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  32.37 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  33.92 
 
 		 363 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  31.87 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  34.29 
 
 		 364 aa  189  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  34.03 
 
 		 417 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  32.84 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  34.12 
 
 		 359 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 373 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  33.92 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  34.28 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.66 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.14 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  30.83 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  32.18 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 		 365 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  36.83 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  32.11 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  30.51 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  34.1 
 
 		 360 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  30.16 
 
 		 435 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  31.05 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  33.23 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  33.53 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  33.23 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>