More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3331 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
766 aa  1573    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 
814 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  40.43 
 
 
824 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 
837 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 
789 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
817 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.05 
 
 
703 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 
708 aa  251  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
850 aa  250  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
815 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.84 
 
 
708 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
860 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 
710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 
701 aa  244  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 
711 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.7 
 
 
711 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 
864 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
734 aa  241  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 
708 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
742 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 
742 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 
710 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 
738 aa  227  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 
738 aa  227  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.96 
 
 
709 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 
689 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
722 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 
825 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
862 aa  220  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
748 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
748 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 
749 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 
825 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 
737 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
701 aa  217  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.5 
 
 
703 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 
741 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 
740 aa  217  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.06 
 
 
833 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 
736 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 
730 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 
819 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 
703 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 
713 aa  213  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 
709 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 
689 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 
701 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  26.22 
 
 
808 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 
715 aa  211  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.03 
 
 
696 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 
821 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 
859 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 
713 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 
692 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 
696 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 
722 aa  209  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 
829 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
755 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 
793 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 
710 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 
722 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 
757 aa  204  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
732 aa  204  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 
735 aa  204  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
809 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 
712 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 
714 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.9 
 
 
708 aa  202  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
702 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
702 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 
707 aa  201  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 
717 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 
815 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 
710 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.5 
 
 
797 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.19 
 
 
806 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 
829 aa  197  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 
828 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 
706 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 
706 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 
810 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  25.3 
 
 
752 aa  194  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 
757 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 
709 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 
797 aa  193  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 
810 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 
779 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 
711 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 
805 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 
712 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 
733 aa  190  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  25.82 
 
 
799 aa  190  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.08 
 
 
703 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 
724 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 
718 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 
740 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 
792 aa  189  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 
810 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 
721 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>