95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3203 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  100 
 
 
981 aa  1985    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  64.42 
 
 
1048 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  33.46 
 
 
1418 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  34.87 
 
 
1085 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.99 
 
 
1410 aa  168  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  25.97 
 
 
1213 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  27.27 
 
 
1200 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.56 
 
 
584 aa  158  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.5 
 
 
1091 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.51 
 
 
1448 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  27.57 
 
 
1000 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  54.29 
 
 
1821 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.68 
 
 
1212 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.84 
 
 
1109 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  41.95 
 
 
1009 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.1 
 
 
823 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  46.25 
 
 
437 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  24.87 
 
 
671 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  24.83 
 
 
675 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  36.88 
 
 
4630 aa  101  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  35.47 
 
 
1300 aa  88.2  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  38.37 
 
 
220 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  39.58 
 
 
556 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  37.13 
 
 
1937 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  37.13 
 
 
1467 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
1361 aa  80.1  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  33.48 
 
 
570 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.97 
 
 
933 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  49.4 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  40.59 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  31.1 
 
 
1556 aa  75.1  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1119  endo-beta-galactosidase, GlcNAc-alpha-1,4-Gal-releasing  38.58 
 
 
420 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.308798  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  52.94 
 
 
306 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  36.2 
 
 
1421 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0362  Ig-like domain-containing protein  28.07 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6083  hypothetical protein  32.79 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.753473  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  38.33 
 
 
1171 aa  72.4  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  32.94 
 
 
1279 aa  72  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  46.24 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  44.33 
 
 
1732 aa  70.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  39.76 
 
 
688 aa  68.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.87 
 
 
2042 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  24.55 
 
 
1831 aa  66.6  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  29.56 
 
 
390 aa  65.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  45.45 
 
 
1226 aa  65.1  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.9 
 
 
752 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  42.39 
 
 
1193 aa  63.9  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  44.05 
 
 
248 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  36.05 
 
 
576 aa  62.4  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  31.98 
 
 
892 aa  62  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  34.97 
 
 
462 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  30.53 
 
 
472 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  34 
 
 
2638 aa  59.7  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  37.58 
 
 
331 aa  58.9  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  34.56 
 
 
1077 aa  58.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 
472 aa  58.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  38.78 
 
 
389 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  33.63 
 
 
942 aa  54.7  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  38.05 
 
 
524 aa  53.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  40.79 
 
 
554 aa  53.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  24.59 
 
 
983 aa  52.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  35.67 
 
 
201 aa  52.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  27.38 
 
 
466 aa  51.6  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  25.31 
 
 
364 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  25.31 
 
 
376 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2642  Ig domain protein group 2 domain protein  25.32 
 
 
889 aa  51.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  40.28 
 
 
316 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  25.31 
 
 
359 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  34.09 
 
 
415 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  33.59 
 
 
399 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0905  gp13  41.89 
 
 
247 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3328  Ig domain-containing protein  35.48 
 
 
878 aa  48.9  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  35.16 
 
 
600 aa  48.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  31.85 
 
 
799 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  26.14 
 
 
657 aa  47  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  33.77 
 
 
907 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.42 
 
 
695 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  31.96 
 
 
1656 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3698  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.72 
 
 
748 aa  46.2  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  31.25 
 
 
2122 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  33.77 
 
 
911 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  33.77 
 
 
911 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0666  hypothetical protein  46.15 
 
 
110 aa  45.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1088  Ig domain-containing protein  36 
 
 
151 aa  45.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.704248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1068  Ig domain-containing protein  36 
 
 
151 aa  45.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.383445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  32.56 
 
 
887 aa  45.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 
1332 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1076  gifsy-2 prophage VmtV  38.1 
 
 
249 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.016765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1148  gifsy-2 prophage VmtV  38.1 
 
 
249 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  32.98 
 
 
545 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  32.47 
 
 
911 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  40.79 
 
 
617 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.59 
 
 
12684 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1413  gifsy-2 prophage VmtV  38.1 
 
 
249 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  33.08 
 
 
1070 aa  44.3  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>