45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3130 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  100 
 
 
572 aa  1186    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  52.64 
 
 
582 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  49.37 
 
 
578 aa  588  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  43.06 
 
 
580 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  28.15 
 
 
534 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  28.15 
 
 
534 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  27.58 
 
 
534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  27.58 
 
 
534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  27.58 
 
 
534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  26.75 
 
 
534 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  24.89 
 
 
536 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  24.79 
 
 
534 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  24.89 
 
 
534 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  22.6 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  22.6 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  24.86 
 
 
477 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
523 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  25.87 
 
 
506 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  23.14 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.34 
 
 
475 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  23.59 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  24.34 
 
 
445 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  24.07 
 
 
466 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.69 
 
 
490 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 
485 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  21.79 
 
 
551 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  23.11 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08206  flavin dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03380)  26.67 
 
 
488 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018027  normal  0.367841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3459  flavin-containing monooxygenase  24.86 
 
 
456 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  23.14 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  24.78 
 
 
580 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  23.14 
 
 
469 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  23.98 
 
 
465 aa  47.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2270  flavin-containing monooxygenase FMO  24.57 
 
 
459 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22913  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  21.66 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  22.58 
 
 
742 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  23.72 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.64 
 
 
622 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  25.85 
 
 
478 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.75 
 
 
258 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  22.79 
 
 
412 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  25.11 
 
 
442 aa  43.5  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  25.64 
 
 
593 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.89 
 
 
443 aa  43.5  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5135  flavin-containing monooxygenase  24.29 
 
 
447 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>