36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3068 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  41.33 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  34.21 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  38.19 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  46.15 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  31.69 
 
 		 326 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  30.82 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  31.69 
 
 		 314 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  28.78 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  30.6 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  29.5 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  33.66 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  32.86 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  28.06 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  29.86 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  28.97 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  32.63 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  28.89 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  29.82 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  24 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.7 
 
 		 473 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  24.21 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  24.21 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  24.21 
 
 		 459 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  27.78 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3921  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  23.03 
 
 		 350 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  23.03 
 
 		 465 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  23.03 
 
 		 465 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  23.03 
 
 		 465 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  23.03 
 
 		 465 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  23.03 
 
 		 465 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  23.03 
 
 		 465 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  22.37 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 463 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>