More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2996 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  100 
 
 
376 aa  746  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  69.44 
 
 
376 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.08 
 
 
391 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.47 
 
 
386 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.24 
 
 
393 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.27 
 
 
387 aa  343  3e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  49.19 
 
 
393 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  52.66 
 
 
389 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.46 
 
 
387 aa  340  3e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.81 
 
 
404 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.7 
 
 
379 aa  327  2e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  48.79 
 
 
378 aa  325  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  45.11 
 
 
382 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  46.34 
 
 
379 aa  314  2e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  43.47 
 
 
376 aa  304  2e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.91 
 
 
352 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  35.17 
 
 
383 aa  198  1e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.17 
 
 
395 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  37.27 
 
 
358 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  32.53 
 
 
385 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.25 
 
 
382 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.95 
 
 
392 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.73 
 
 
472 aa  175  1e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.98 
 
 
472 aa  174  3e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  31.5 
 
 
393 aa  172  8e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.81 
 
 
397 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  29.38 
 
 
398 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.67 
 
 
348 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30.05 
 
 
396 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30.05 
 
 
396 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  30.05 
 
 
396 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.73 
 
 
396 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  28.53 
 
 
390 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  28.8 
 
 
394 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  30.25 
 
 
442 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  30.48 
 
 
399 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.27 
 
 
400 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  28.27 
 
 
392 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  28.27 
 
 
392 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.15 
 
 
390 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  27.5 
 
 
453 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.86 
 
 
390 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  29.81 
 
 
412 aa  148  1e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  30.66 
 
 
412 aa  148  1e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30 
 
 
401 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  31.07 
 
 
401 aa  146  7e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  30.61 
 
 
393 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  30.73 
 
 
401 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  28.95 
 
 
390 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  28.95 
 
 
390 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.28 
 
 
450 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  28.07 
 
 
456 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  29.25 
 
 
428 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  28.35 
 
 
390 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.24 
 
 
456 aa  141  2e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.98 
 
 
441 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  30.71 
 
 
408 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  29.76 
 
 
456 aa  140  5e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  29.02 
 
 
447 aa  140  5e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  31.3 
 
 
408 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  28.42 
 
 
450 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  26.03 
 
 
443 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  29.31 
 
 
430 aa  136  7e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  27.16 
 
 
444 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.88 
 
 
454 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  26.99 
 
 
388 aa  135  1e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03685e-05 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  28.05 
 
 
402 aa  134  2e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.24 
 
 
441 aa  134  2e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  30.06 
 
 
393 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.03 
 
 
420 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  30.81 
 
 
393 aa  133  4e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  30.06 
 
 
393 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01188e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  30.81 
 
 
393 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  30.84 
 
 
393 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  27.03 
 
 
450 aa  132  1e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  27.96 
 
 
388 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  28.02 
 
 
454 aa  130  4e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  27.81 
 
 
463 aa  130  5e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  29.74 
 
 
393 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31811e-11 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  30.24 
 
 
393 aa  129  8e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  27.07 
 
 
412 aa  129  8e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  29.71 
 
 
407 aa  128  1e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  29.71 
 
 
407 aa  128  1e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  27.02 
 
 
425 aa  129  1e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.7 
 
 
416 aa  129  1e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  25.06 
 
 
493 aa  128  2e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  25.56 
 
 
483 aa  127  2e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  29.33 
 
 
393 aa  127  2e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  29.43 
 
 
397 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  25.6 
 
 
456 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  25.35 
 
 
432 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  27.32 
 
 
392 aa  127  4e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  28.17 
 
 
401 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  29.77 
 
 
393 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  25.85 
 
 
405 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  26.77 
 
 
408 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  25 
 
 
463 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  28.11 
 
 
428 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  28.76 
 
 
346 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  26.04 
 
 
413 aa  122  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>