More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2939 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
352 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  53.28 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.7 
 
 
362 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.99 
 
 
357 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.72 
 
 
351 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 
362 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  38.15 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.13 
 
 
390 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.14 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 
367 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 
380 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  31.28 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 
388 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  29.66 
 
 
374 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 
376 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  29.78 
 
 
367 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  29.61 
 
 
406 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 
382 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 
358 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  32.08 
 
 
379 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 
381 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  27.76 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  30.23 
 
 
360 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 
370 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 
394 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 
371 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 
390 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.14 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  28.95 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.33 
 
 
375 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  29.5 
 
 
354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 
372 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.44 
 
 
368 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  28.25 
 
 
368 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 
365 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 
372 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  29.9 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.65 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  30.23 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  30.48 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  27.62 
 
 
361 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  27.84 
 
 
382 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
383 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 
363 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 
363 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  28.81 
 
 
360 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  28.74 
 
 
366 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.81 
 
 
383 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
369 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 
366 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 
364 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  27.25 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  29.62 
 
 
385 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  30.46 
 
 
348 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  27.64 
 
 
371 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 
372 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  28.76 
 
 
318 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  30.96 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 
376 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  27.8 
 
 
467 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  28.93 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  28.41 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.62 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 
366 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.57 
 
 
374 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  28.3 
 
 
378 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 
360 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 
355 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
368 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09530  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.33 
 
 
370 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  26.78 
 
 
360 aa  122  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  29.87 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 
353 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>