95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2824 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  53.53 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  49.14 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  38.84 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  21.49 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  24.4 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  22.31 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  23.64 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  26.4 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  21.88 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  24.38 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  23.79 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.5 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.21 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  22 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.16 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  28.04 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  22.36 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.67 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  25.31 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  18.97 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  21.34 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  21.51 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  22.77 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  23.67 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  19.92 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  24 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.67 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  20.26 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  23.74 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  21.8 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  20.45 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3884  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  20.32 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  19.52 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  19.87 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2143  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.1 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  20 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  26.49 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  18.59 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  27.17 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3326  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2980  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  19.41 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  18.57 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  23.55 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  19.2 
 
 		 278 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 277 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 		 257 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 272 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>