104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2813 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  100 
 
 		 773 aa  1539    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  24.94 
 
 		 829 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 754 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.6 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  22.46 
 
 		 607 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  22.11 
 
 		 1090 aa  65.1  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  22.53 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  27.42 
 
 		 495 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  23.31 
 
 		 832 aa  60.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  24.2 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  23.97 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  20.51 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  22.6 
 
 		 1065 aa  58.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  26.05 
 
 		 435 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  24.03 
 
 		 443 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  22.98 
 
 		 425 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0727  exsB protein  28.35 
 
 		 1310 aa  55.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.202441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.35 
 
 		 440 aa  55.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  23.62 
 
 		 443 aa  54.7  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  22.99 
 
 		 433 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  27.33 
 
 		 398 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  35.4 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  34.04 
 
 		 496 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  30.07 
 
 		 457 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  24.84 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  30.07 
 
 		 457 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  30.07 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  25 
 
 		 402 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 366 aa  52.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  33.96 
 
 		 404 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 590 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  24.09 
 
 		 436 aa  52  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  24.27 
 
 		 738 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 470 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  29.49 
 
 		 512 aa  51.6  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  21.13 
 
 		 415 aa  51.6  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 612 aa  51.6  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  34.1 
 
 		 449 aa  51.2  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  31.65 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  31.65 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  31.65 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  31.65 
 
 		 404 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  23.03 
 
 		 430 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  21.11 
 
 		 503 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  25.41 
 
 		 465 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  21.43 
 
 		 1065 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  26.72 
 
 		 409 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 784 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  22.43 
 
 		 467 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 428 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  25.8 
 
 		 781 aa  49.3  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  26.49 
 
 		 405 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  26.02 
 
 		 438 aa  48.5  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4268  O-antigen polymerase  28.85 
 
 		 448 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  26.72 
 
 		 409 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0270  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 425 aa  48.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.143785  normal  0.425516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  31.65 
 
 		 503 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 504 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  21.2 
 
 		 594 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  21.58 
 
 		 589 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  24.03 
 
 		 457 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  27.16 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  21.85 
 
 		 456 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 440 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  25 
 
 		 434 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  24.12 
 
 		 785 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  29.47 
 
 		 502 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.27 
 
 		 436 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  30.71 
 
 		 686 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  30.71 
 
 		 686 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2987  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 266 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  22.29 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 209 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  33.73 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  25.82 
 
 		 436 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  24 
 
 		 467 aa  45.8  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  25.55 
 
 		 492 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  27.92 
 
 		 431 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 		 571 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  21.97 
 
 		 588 aa  45.8  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6488  O-antigen polymerase  23.01 
 
 		 442 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  20.94 
 
 		 1070 aa  45.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  26.83 
 
 		 437 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 520 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.85 
 
 		 818 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.85 
 
 		 784 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0117  hypothetical protein  24.26 
 
 		 412 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.706164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0122  hypothetical protein  24.26 
 
 		 412 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1208  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 426 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  23.53 
 
 		 415 aa  45.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 509 aa  44.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 329 aa  44.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1351  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 448 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  31.88 
 
 		 396 aa  44.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1123  O-antigen polymerase  22.12 
 
 		 442 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 233 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>