More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2720 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 372 aa  751    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  77.62 
 
 		 362 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  70.43 
 
 		 374 aa  555  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  55.23 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  51.21 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3720  DNA polymerase III, beta subunit  51.21 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.626306  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  50.56 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4880  DNA polymerase III, beta subunit  47.51 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0152  DNA polymerase III subunit beta  42.36 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.89 
 
 		 379 aa  275  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1853  DNA polymerase III, beta subunit  35.2 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.01 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.07 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.13 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.02 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.89 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.53 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.53 
 
 		 374 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 		 375 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 		 374 aa  185  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.22496  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0001  DNA-directed DNA polymerase  32.18 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000454197  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.39 
 
 		 372 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  29.13 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.08 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0002  DNA polymerase III, beta chain  31.15 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0511069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.79 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.03 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000101704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.81 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.62 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  28.61 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.26 
 
 		 365 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.21 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.92 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.01 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  29.04 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  27.88 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.89 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  25.99 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.55 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.74 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  29.64 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.54 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.55 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.59 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000744787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.01 
 
 		 373 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.01 
 
 		 372 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  26.37 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.89 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.96 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  29.87 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  29.12 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4145  DNA polymerase III, beta subunit  29.23 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.258487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3441  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 		 371 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.325472  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 369 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  27.96 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0132  DNA polymerase III, beta subunit  29.86 
 
 		 370 aa  162  9e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3715  DNA polymerase III, beta subunit  29.53 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0290452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.43 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.04 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.37 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.94 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4176  DNA polymerase III subunit beta  27.94 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000208549  normal  0.014688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.45 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4152  DNA polymerase III subunit beta  27.94 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.9 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.24 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.05 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.74 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 		 366 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  26.84 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.46 
 
 		 382 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  26.95 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.11 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00413752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.85 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3240  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 368 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2849  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>