More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2289 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  52.67 
 
 
675 aa  719    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  53.31 
 
 
712 aa  727    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  53.4 
 
 
719 aa  739    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  100 
 
 
768 aa  1584    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  55.47 
 
 
707 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  37.66 
 
 
799 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  37.27 
 
 
701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  43.56 
 
 
608 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  40.59 
 
 
721 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  41.98 
 
 
729 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 
867 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  37.36 
 
 
722 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  38.05 
 
 
729 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  37.84 
 
 
620 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  38.2 
 
 
729 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 
729 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 
729 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  38.05 
 
 
729 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 
729 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 
729 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  38.48 
 
 
686 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  38.2 
 
 
729 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  37.91 
 
 
729 aa  416  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  36.17 
 
 
695 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  38.64 
 
 
729 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  38.44 
 
 
729 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  36.78 
 
 
731 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 
731 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  36.44 
 
 
744 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  34.36 
 
 
754 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  34.9 
 
 
718 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  34.72 
 
 
714 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  36.83 
 
 
697 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  34.36 
 
 
777 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  34.21 
 
 
714 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  34.21 
 
 
714 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  34.08 
 
 
714 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  33 
 
 
846 aa  386  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  34.48 
 
 
689 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  32.82 
 
 
865 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  34.21 
 
 
714 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  34.21 
 
 
714 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 
889 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  33.29 
 
 
876 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  33.25 
 
 
877 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  34.08 
 
 
714 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  34.08 
 
 
714 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  33.94 
 
 
714 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  34.08 
 
 
714 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  33.9 
 
 
992 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  32.95 
 
 
888 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  32.69 
 
 
865 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  34.65 
 
 
730 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  32.69 
 
 
865 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  33.16 
 
 
876 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 
869 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  32.57 
 
 
865 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 
869 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  32.4 
 
 
865 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 
906 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  32.44 
 
 
891 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  34.72 
 
 
891 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  33.7 
 
 
975 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 
869 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 
869 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  32.36 
 
 
865 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 
869 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  32.53 
 
 
854 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  32.48 
 
 
865 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0093  topoisomerase IA  35.22 
 
 
722 aa  379  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  33.21 
 
 
920 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  32.65 
 
 
869 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  33.93 
 
 
714 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  32.66 
 
 
839 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  32.31 
 
 
908 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.08 
 
 
573 aa  372  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  34.92 
 
 
673 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  34.32 
 
 
896 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  36.52 
 
 
689 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  32.37 
 
 
1002 aa  369  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  31.38 
 
 
876 aa  369  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  32.11 
 
 
851 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  32.25 
 
 
920 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  33.04 
 
 
981 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  34.57 
 
 
982 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  32.12 
 
 
981 aa  366  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  34.15 
 
 
879 aa  366  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  32.02 
 
 
990 aa  365  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  36.74 
 
 
939 aa  363  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  35.89 
 
 
680 aa  362  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  34.2 
 
 
707 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  35.83 
 
 
681 aa  362  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  34.69 
 
 
652 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  34.55 
 
 
697 aa  357  5e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  33.02 
 
 
980 aa  357  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  32.17 
 
 
876 aa  356  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  33.58 
 
 
671 aa  355  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  34.83 
 
 
654 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  32.99 
 
 
670 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  33.73 
 
 
671 aa  353  8.999999999999999e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>