More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2210 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 344 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  78.13 
 
 		 339 aa  535  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  72.09 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.05 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.52 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  61.58 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.4 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.77 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.85 
 
 		 356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  45.8 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.29 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  50.3 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  49.7 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 336 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 336 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 336 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.81 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  46.17 
 
 		 377 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.23 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  46.65 
 
 		 375 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 340 aa  295  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 		 354 aa  295  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.82 
 
 		 336 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.93 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.48 
 
 		 346 aa  292  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.41 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 360 aa  292  6e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.63 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 378 aa  292  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  44.51 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.51 
 
 		 339 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 363 aa  288  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  44.8 
 
 		 361 aa  288  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.75 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.38 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  44.44 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.63 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.5 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  45.43 
 
 		 361 aa  285  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  48.69 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 		 336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.31 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.22 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.04 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  46.67 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  44.03 
 
 		 360 aa  282  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 		 351 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.15 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.7 
 
 		 355 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 		 339 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.96 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  43.75 
 
 		 352 aa  281  9e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.99 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  47.08 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>