More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2190 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  100 
 
 
394 aa  779  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  55.04 
 
 
387 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  56.64 
 
 
410 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.72 
 
 
399 aa  285  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.72 
 
 
399 aa  285  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.72 
 
 
399 aa  285  1e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.21 
 
 
383 aa  282  6e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  42.01 
 
 
403 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  42.78 
 
 
404 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
403 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.16 
 
 
394 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
394 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.64 
 
 
394 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.64 
 
 
394 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
394 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  38.73 
 
 
390 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
394 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
406 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 
406 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
399 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
394 aa  263  5e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
397 aa  262  7e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 
389 aa  262  9e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  41.23 
 
 
399 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
391 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  40.77 
 
 
400 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 
413 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.76 
 
 
394 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.64 
 
 
394 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  41.76 
 
 
394 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  41.76 
 
 
394 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  40.72 
 
 
389 aa  254  1e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  40.72 
 
 
389 aa  254  1e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.02 
 
 
407 aa  253  4e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  41.76 
 
 
394 aa  253  5e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  40.21 
 
 
399 aa  252  8e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 
399 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  40.57 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  40.57 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.25 
 
 
389 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.59 
 
 
399 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  41.22 
 
 
395 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.41 
 
 
415 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.59 
 
 
399 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.82 
 
 
405 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.99 
 
 
385 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  41.78 
 
 
399 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  41.94 
 
 
398 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  36.67 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.83 
 
 
395 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  35.77 
 
 
399 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
415 aa  244  2e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
389 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
398 aa  243  4e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
429 aa  243  4e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
398 aa  243  4e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
398 aa  243  4e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
398 aa  243  4e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
398 aa  243  4e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
399 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
429 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 
389 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  41.42 
 
 
398 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 
402 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  37.56 
 
 
415 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 
402 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.61 
 
 
411 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  36.32 
 
 
405 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  36.32 
 
 
405 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 
394 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  40.73 
 
 
402 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
389 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  39.79 
 
 
399 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  36.92 
 
 
405 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  36.32 
 
 
405 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.67 
 
 
393 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 
396 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  36.92 
 
 
405 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 
394 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 
396 aa  236  5e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  38.44 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  39.23 
 
 
394 aa  235  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  37.89 
 
 
399 aa  235  1e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  40.95 
 
 
399 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  38.89 
 
 
400 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  39.61 
 
 
400 aa  232  7e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  39.61 
 
 
400 aa  232  8e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
408 aa  232  8e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  41.78 
 
 
398 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 
423 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  39.28 
 
 
403 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 
407 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  41.32 
 
 
329 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 
413 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  37.63 
 
 
391 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  1.66249e-05 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.63 
 
 
404 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  38.82 
 
 
397 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  38.86 
 
 
395 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  34.54 
 
 
421 aa  221  2e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
408 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>