More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2138 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
436 aa  894  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09873  putative cell-cycle protein  47.93 
 
 
436 aa  418  1e-115  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.96 
 
 
431 aa  340  3e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5217  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.78 
 
 
444 aa  337  3e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.82 
 
 
450 aa  308  9e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.43 
 
 
445 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1198  hypothetical protein  38.76 
 
 
454 aa  290  5e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.62 
 
 
446 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.623923 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  32.58 
 
 
454 aa  260  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.39704e-06 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.35 
 
 
465 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.6 
 
 
461 aa  217  3e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.67 
 
 
454 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.04 
 
 
480 aa  199  8e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.67 
 
 
470 aa  197  2e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.64425e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.12 
 
 
457 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.76 
 
 
457 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  26.79 
 
 
455 aa  184  2e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.9 
 
 
473 aa  185  2e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.51 
 
 
459 aa  183  5e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.20326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.53 
 
 
456 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.84 
 
 
469 aa  174  4e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.45 
 
 
468 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.45 
 
 
464 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.44 
 
 
334 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  25.86 
 
 
444 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0704  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.39 
 
 
328 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.53 
 
 
469 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.25 
 
 
471 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  27.42 
 
 
468 aa  167  3e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.60009e-09  hitchhiker  6.38883e-11 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.27 
 
 
325 aa  167  3e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.48 
 
 
456 aa  167  3e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.83 
 
 
458 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.25177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.58 
 
 
462 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  35.92 
 
 
354 aa  166  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.32 
 
 
481 aa  166  1e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.91 
 
 
492 aa  165  1e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.48 
 
 
470 aa  166  1e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  26.62 
 
 
471 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  27.27 
 
 
464 aa  163  5e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.56 
 
 
311 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  25.95 
 
 
476 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.55 
 
 
325 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.74 
 
 
464 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.39 
 
 
476 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.65 
 
 
470 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265542  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  26.22 
 
 
458 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.44135e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.85 
 
 
457 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.67197e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.25 
 
 
472 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.05 
 
 
476 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.51 
 
 
476 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.32242e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.27 
 
 
476 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  25.95 
 
 
470 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  38.81 
 
 
332 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.13 
 
 
455 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.22 
 
 
682 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.84 
 
 
442 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.94 
 
 
442 aa  149  1e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  27.46 
 
 
476 aa  147  2e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  27.46 
 
 
476 aa  147  2e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.21 
 
 
476 aa  147  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.54 
 
 
476 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  27.54 
 
 
476 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  27.54 
 
 
476 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.54 
 
 
476 aa  147  4e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.92 
 
 
476 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  27.23 
 
 
476 aa  146  7e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.39 
 
 
485 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  7.93902e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.05 
 
 
457 aa  143  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1341  hypothetical protein  41.58 
 
 
460 aa  142  1e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0541  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.02 
 
 
336 aa  142  1e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41194  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.79 
 
 
419 aa  139  9e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.38 
 
 
414 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0402  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  25.59 
 
 
430 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.13 
 
 
241 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  7.25449e-11 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.48 
 
 
509 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1815  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.32 
 
 
450 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.195712  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.47 
 
 
306 aa  135  2e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
676 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0148  MesJ/Ycf62 family protein  29.52 
 
 
432 aa  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.49 
 
 
472 aa  133  8e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.75887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.95 
 
 
474 aa  133  8e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.6 
 
 
423 aa  131  2e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.82 
 
 
338 aa  128  2e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.22 
 
 
489 aa  128  2e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.31319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.26 
 
 
445 aa  127  4e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.61 
 
 
462 aa  126  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.47 
 
 
460 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1752  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.71 
 
 
334 aa  122  1e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927815  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.02 
 
 
438 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0544  hypothetical protein  27.52 
 
 
431 aa  120  4e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000216418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.88 
 
 
427 aa  120  4e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0014  MesJ/Ycf62 family protein  27.1 
 
 
424 aa  120  4e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0531  hypothetical protein  27.52 
 
 
431 aa  120  4e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00156827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2901  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.47 
 
 
371 aa  120  5e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  34.67 
 
 
431 aa  120  5e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0012  putative cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family  27.59 
 
 
421 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.44 
 
 
426 aa  119  1e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.88 
 
 
427 aa  119  1e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  34.67 
 
 
431 aa  119  1e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35 
 
 
524 aa  118  2e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>