More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2076 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  36.45 
 
 		 1355 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  35.08 
 
 		 1374 aa  792    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  100 
 
 		 1373 aa  2786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.1 
 
 		 1378 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  30.62 
 
 		 1363 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.31 
 
 		 1388 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  35.57 
 
 		 1370 aa  894    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  33.26 
 
 		 1400 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  32.17 
 
 		 1397 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.16 
 
 		 1374 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  31.77 
 
 		 1306 aa  632  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  31.75 
 
 		 1340 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  29.77 
 
 		 1378 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31.55 
 
 		 1373 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  30.7 
 
 		 1384 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  31.38 
 
 		 1366 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  29.88 
 
 		 1355 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  29.19 
 
 		 1418 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.69 
 
 		 1347 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  30.7 
 
 		 1316 aa  562  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  28.48 
 
 		 1342 aa  562  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  31.01 
 
 		 1278 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  29.07 
 
 		 1324 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  28.98 
 
 		 1334 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  29.38 
 
 		 1335 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  29.42 
 
 		 1313 aa  543  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.93 
 
 		 1327 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 1349 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  28.45 
 
 		 1343 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  26.62 
 
 		 1404 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  29.6 
 
 		 1344 aa  496  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  28.04 
 
 		 1526 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  33.52 
 
 		 1311 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  27.82 
 
 		 1374 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  26.45 
 
 		 1347 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  27.22 
 
 		 1298 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  26.18 
 
 		 1414 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  27.01 
 
 		 1376 aa  453  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  27.11 
 
 		 1344 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  27.09 
 
 		 1407 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  29.43 
 
 		 1366 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.61 
 
 		 1396 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  27.06 
 
 		 1105 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 1258 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  28 
 
 		 1093 aa  355  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  28.65 
 
 		 1070 aa  355  5e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.03 
 
 		 934 aa  352  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 904 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  28.24 
 
 		 1070 aa  349  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  27.79 
 
 		 1086 aa  348  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 940 aa  341  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  24.81 
 
 		 1278 aa  336  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  25.79 
 
 		 1296 aa  327  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  29.22 
 
 		 1054 aa  323  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 1341 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  27.22 
 
 		 1118 aa  322  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 677 aa  314  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 		 1498 aa  301  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.1 
 
 		 1114 aa  300  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.04 
 
 		 663 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 668 aa  287  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  24.1 
 
 		 1004 aa  285  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 1431 aa  266  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  23.68 
 
 		 1024 aa  264  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  23.61 
 
 		 1346 aa  262  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 961 aa  260  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.83 
 
 		 1351 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  21.77 
 
 		 1190 aa  259  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  22.22 
 
 		 1175 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  22.05 
 
 		 1179 aa  254  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 1711 aa  253  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 1002 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1406 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 1131 aa  248  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 1153 aa  247  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 1390 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1390 aa  246  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1390 aa  246  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  34.21 
 
 		 1299 aa  244  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.87 
 
 		 1084 aa  243  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 1118 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 1048 aa  240  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 1559 aa  240  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 1370 aa  238  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 1140 aa  238  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1426 aa  238  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  26.5 
 
 		 1053 aa  237  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  30.43 
 
 		 993 aa  237  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 1383 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  20.86 
 
 		 1185 aa  237  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.74 
 
 		 1079 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  32.95 
 
 		 1427 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 1361 aa  233  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.7 
 
 		 1152 aa  232  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  20.29 
 
 		 1191 aa  231  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 1415 aa  230  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 1385 aa  230  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 1013 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 1010 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.98 
 
 		 1514 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>