201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2027 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 325 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  56.38 
 
 		 319 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  53.16 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  45.29 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  37.29 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  31.74 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  32.18 
 
 		 384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  31.02 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  34.19 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  34.74 
 
 		 644 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.95 
 
 		 509 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  32.96 
 
 		 524 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.38 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  28.98 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.01 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.19 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 522 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  31.87 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  32.91 
 
 		 533 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.39 
 
 		 501 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.48 
 
 		 495 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.94 
 
 		 472 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  29.31 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  29.33 
 
 		 855 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.49 
 
 		 618 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  30.21 
 
 		 464 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.83 
 
 		 444 aa  85.9  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  30.74 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  30.04 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  31.1 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.63 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.39 
 
 		 576 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  23.36 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.34 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  28.95 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  24.46 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.54 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 540 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  23.99 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.22 
 
 		 540 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25.08 
 
 		 541 aa  69.3  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.87 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.36 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.29 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  27 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.56 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 563 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  22.32 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.9 
 
 		 523 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 		 497 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  23.92 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  28.02 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.2 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.5 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.56 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  23.57 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  23.05 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.48 
 
 		 577 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.04 
 
 		 746 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  26.07 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  26.01 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  24.01 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.27 
 
 		 545 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  23.45 
 
 		 586 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  24.58 
 
 		 512 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  23.79 
 
 		 527 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.33 
 
 		 546 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.77 
 
 		 713 aa  62.4  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.95 
 
 		 537 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  28.02 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.92 
 
 		 541 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.29 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.39 
 
 		 648 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  22.95 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  26.71 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>