More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2015 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
306 aa  626  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.21 
 
 
311 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.68 
 
 
322 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
305 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
299 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
309 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.44 
 
 
312 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
307 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
308 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.33 
 
 
326 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.01 
 
 
305 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.35 
 
 
320 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.01 
 
 
305 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
314 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
309 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
310 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
315 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.35 
 
 
310 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.85 
 
 
308 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.02 
 
 
304 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  28.71 
 
 
318 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
310 aa  155  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
329 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.91 
 
 
325 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.01 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
326 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
326 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
326 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
336 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
325 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.4 
 
 
848 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
166 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
321 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
337 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  27.61 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.21 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  28.2 
 
 
321 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
162 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
143 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.2 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  25.09 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
163 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.69 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
161 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  21.57 
 
 
326 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  26.42 
 
 
161 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
161 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.2 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  22.26 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  22.44 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.26 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  22.26 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  22.98 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
162 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  21.63 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  38.68 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  20.7 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.22 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  23.49 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  22.79 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  23.37 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.03 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
179 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000087115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  20.14 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
212 aa  60.1  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  27.88 
 
 
184 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
189 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.74 
 
 
159 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  30.53 
 
 
196 aa  56.2  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
144 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  20.81 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  36.76 
 
 
189 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
154 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  40 
 
 
140 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  39.47 
 
 
153 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  29.35 
 
 
195 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  28.12 
 
 
161 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
170 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
212 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
152 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
189 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
168 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
173 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>