92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1998 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 344 aa  710    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  61.9 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  63.95 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  62.27 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  60.38 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.37 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  60.57 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  58.77 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  59.15 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  53.78 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.81 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  47.94 
 
 		 335 aa  312  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  38.89 
 
 		 450 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.04 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  34.12 
 
 		 1186 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.62 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  32.6 
 
 		 464 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.01 
 
 		 468 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  31.78 
 
 		 533 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.66 
 
 		 618 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  32.38 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 524 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  31.61 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  32.93 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  31.5 
 
 		 679 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 		 311 aa  123  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.99 
 
 		 527 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  27.64 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.23 
 
 		 712 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.23 
 
 		 1338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  29.94 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  28.21 
 
 		 487 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  30.21 
 
 		 667 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.04 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 644 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.74 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.45 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.4 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.59 
 
 		 471 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 471 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.95 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  23.55 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.44 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  27.84 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.66 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  23.41 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.81 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.58 
 
 		 576 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 		 472 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  30.23 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  34.57 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  23.75 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.05 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  36.14 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  22.71 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  28.21 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  23.89 
 
 		 789 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 456 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  27.94 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.09 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 855 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 512 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.55 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.9 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.66 
 
 		 616 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.07 
 
 		 540 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  29.63 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.3 
 
 		 562 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  24.66 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.77 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  32.18 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  30.95 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 1143 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 543 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 		 465 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  37.66 
 
 		 535 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>